枯山水：枯山水是日式庭院中最具代表性的元素之一，它运用写意的手法，以石块象征山峦，白沙象征湖海，点缀少量的灌木或苔藓、薇蕨等植物，营造出一种在“方寸之地幻出千岩万壑”的意境。这种景观常与禅学联系在一起，通过对空与有、虚与实的隐喻和顿悟，表达心灵的观照。
惊鹿（添水）：惊鹿是一种竹制小品，利用杠杆原理，当竹筒上部注满水后，自然下垂倒空筒中水，再翘头回复平衡，尾部击打在撞石上发出清脆声响。它不仅为庭院增添了一丝生动与趣味，还象征着宁静致远，是日式庭院中的代表元素之一。
蹲踞：蹲踞是日式庭院中常见的一种景观小品，通常与惊鹿配合使用，作为茶道等正式仪式前洗手用的道具。蹲踞一般为石材制作，并摆放有小竹勺和顶部提供水源的竹制水渠，寓意着清洗身体和内心的罪恶。
石灯笼：石灯笼是日式庭院中不可或缺的元素之一，传统的石灯笼有多种样式，一般在其中点上蜡烛，在夜间有很好的景观效果。即使不点灯，石灯笼自身的造型和美感也构成了一种独特的景观。
汀步与石阶：日式庭院中的汀步和石阶做法灵感来源于大自然，充满野味的同时又带有几分美妙的曲线。它们与庭院整体风格融为一体，引导人们一步步走入这个禅意庭园。
小桥：小桥为日式庭院增添了层次感，是连接自然与人文的纽带。站在远处凝视小桥，别有一番趣味。
竹篱：竹篱笆是日式庭院中必不可少的元素，主要用作围屏。它的原材料除了原生竹之外，近年来铝制和塑料制人工竹也因其不易腐烂等特性而得到广泛应用。竹篱笆为庭院带来私密感的同时，又保持了通透感。
中门：中门为日式庭院带来私密感，半遮半掩间让人不自觉地想要穿过它走进庭院深处去一探究竟。木门木瓦的中门令人感到怀旧、质朴，配合四周的竹栅栏，还能增加审美情趣。
植物：日式庭院中的植物选择也极具特色，如日本红枫、苔藓、松树等，寓意着思念、新生、延年，营造古刹的清肃感。还有樱花、乌桕树、红豆杉、铁冬青等，这些植物的选择和搭配旨在增强庭院的季节感和自然氛围。
架空木平台：由于日本地理潮湿，一般的房子都做架空的设计以避免毒虫的侵袭。架空木平台不仅有效地拓展了室内空间，还为庭院增加了一个观赏点。
